تتبع التقسیم الذی سار علیه الدکتور موریس تاوضروس فی مذکرته عن هذا الإنجیل لطلاب کلیتی اللاهوت و الإکلیرکیة التابعتین للکنیسة القبطیة المصریة بالقاهرة. لأنه أشمل و أیسر.
فیمکن: أن نقسم النص إلی مقدمة و ستة أقسام و خاتمة.
المقدمة: عن المسیح الکلمة من (بدایة الإصحاح الأول حتی آیة 13(.
أ- وجود الکلمة عند الله التی هی هو منذ البدء (1- 5(.
ب- حدیث عن یوحنا الذی جاء للشهادة للإله النور (1: 5- 8(.
ج- رفض بعض الیهود للإله الکلمة النور و قبول بعضهم له: (1: 8- 13(.
در پرتو عنایت خداوند متعال و توجهات حضرت ولیعصر (عج) و پیرو تاکید مقام معظم رهبری بر تلاش در عرصه نوسازی و اعتلای پژوهش‌های دینی و اسلامی با حداکثر استفاده از روش‌ها و ابزارهای جدید به امر مرجع عالیقدر حضرت آیه الله العظمی مظاهری دامت برکاته در آذرماه سال ۱۳۷۷ تاسیس شده است.
تا کنون گام‌های موثر و چشمگیری در راستای پیشبرد و اعتلای پژوهش‌های اسلامی برداشته که علاوه بر تولید ده‌ها نرم‌افزار دینی، به تحقیق و انتشار کتب مفیدی دست زده است که تاثیر این تحول بنیادی مورد توجه و قبول عالمان، محققان و اندیشمندان جامعه اسلامی قرار گرفته است و تاکنون توانسته رتبه‌های متعددی از جمله خادم قرآن کریم (۱۳۸۴) و خادم فرهنگ عمومی (۱۳۸۶) کسب نماید.
