النسخة الفاتیکانیة: و هی أقدم النسخ، و ترجع إلی أوائل القرن الرابع المیلادی وعد بعدها الکاتب أربع نسخ أحدث منها تاریخیا.
ونحن نلاحظ أنه لا علاقة بین هذه النسخة وما تلاها بموضوعنا فإن یوحنا لم
یکتبها بیده، و هی لم تکتب إلا بعد موته بثلاثة قرون تقریبا. و شهادة النسخ لا تقبل إلا إذا کانت قد کتبت فی عصر المؤلف و حازت موافقته.
در پرتو عنایت خداوند متعال و توجهات حضرت ولیعصر (عج) و پیرو تاکید مقام معظم رهبری بر تلاش در عرصه نوسازی و اعتلای پژوهش‌های دینی و اسلامی با حداکثر استفاده از روش‌ها و ابزارهای جدید به امر مرجع عالیقدر حضرت آیه الله العظمی مظاهری دامت برکاته در آذرماه سال ۱۳۷۷ تاسیس شده است.
تا کنون گام‌های موثر و چشمگیری در راستای پیشبرد و اعتلای پژوهش‌های اسلامی برداشته که علاوه بر تولید ده‌ها نرم‌افزار دینی، به تحقیق و انتشار کتب مفیدی دست زده است که تاثیر این تحول بنیادی مورد توجه و قبول عالمان، محققان و اندیشمندان جامعه اسلامی قرار گرفته است و تاکنون توانسته رتبه‌های متعددی از جمله خادم قرآن کریم (۱۳۸۴) و خادم فرهنگ عمومی (۱۳۸۶) کسب نماید.
